Очевидно-неочевидные вопросы
 

В чем разница между маршрутом сквозного пропуска с сигнализацией два желтых верхний мигающий при открытом выходном и ситуацией когда на входном светофре горит два желтых с открытым выходным? Там и там поезда едут не останавливаясь. В скорости?

цитата из ИСИ:

4) два желтых огня, из них верхний мигающий – разрешается поезду следовать на железнодорожную станцию с уменьшенной скоростью на боковой железнодорожный путь; следующий светофор (маршрутный или выходной) открыт (рис. 4);
5) два желтых огня – разрешается поезду следовать на железнодорожную станцию с уменьшенной скоростью на боковой железнодорожный путь и готовностью остановиться; следующий светофор закрыт (рис. 5);

Батенька, при задании сначала маршрута приема и открытия входного на "2 желтых", и последующего задания маршрута отправления, на входном измениться сигнальное показание на "2 желтых, верхний мигающий"

В первом случае локомотивная бригада до проезда входного светофора знает, что выходной (маршрутный) открыт.
Т.к. скорость приема на бок в большинстве случаев позволяет не рассматривать дополнительное ограничение скорости проследования входного светофора для остановки у закрытого выходного (маршрутного) то мигание имеет чисто информационное значение.

Разница в том, что во втором случае сигнализация безостановочного пропуска не предусмотрена. Почему не предусмотрена - это уже второй вопрос.

и еще на всякий случай цитата из ИСИ:
Сигнализация входного светофора для приема поездов на железнодорожную станцию с неправильного железнодорожного пути двухпутного (многопутного) перегона должна соответствовать сигнализации входного светофора для приема с правильного железнодорожного пути.

И ещё из инструкции по движению (которую вроде не переработали) п.1.5. з) (могу ошибиться под рукой нет) - скорость входа на станцию с неправильного пути не должна превышать скорость бокового.
И вот ситуация на ЧД зеленый, а машинист его проследует и будет следовать дальше допустим по второму пути со скоростью 25 км/час.

Обычно на дополнительном нет зеленого, только 2 желтых и красный

Не все боковые пути предназначены для сквозного пропуска например: не оборудован АЛС, выходные с пути карликовые или в кривой (во время следования по этому пути требуется повышеное внимание машинистов).
По этому и делают сигнализацию на входном о том, что якобы выходной закрыт пока сам машинист не убедится визуально в том что выходной открыт.

Ну не так же...
Сигнализация безостановочного пропуска предусматривается для одного, в редких случаях - для двух боковых путей. Это отражается на схемплане и в ТРА. Для остальных боковых путей - при их наличии - такая сигнализация не устраивается.

Маршрут сквозного пропуска предусматривается на путях безостановочного пропуска. При этом показания входного светофора на станцию увязываются с показаниями выходного с пути безостановочного пропуска. Со всех остальных путей такой увязки нет, что не мешает вам задать 2 маршрута на прием и отправление.

Добрый день!!! подскажите пожалуйста причины неисправности светофора (выходного) и действия работников при этой неисправности.

Да запАрили вы уже своей тупостью!
Нет понятия "сквозной пропуск". Вот ляпнул кто-то и понеслось...
Изолированный стык.

Для того, чтобы при открытии выходного светофора на входном сигнальные показания с "двух желтых" сменились на "2 желтых, верхний мигающий" должны быть произведены некоторые схемные решения, а именно: в хвосте 5 линейки входного светофора при движении по пути безостановочного пропуска устанавливаются контакты сигнального реле выходного светофора по данному пути(в БМРЦ на 1-22, или 2-22 блока пути). Если такого не сделано, то безостановочного пропуска по данному пути не предусмотрено и, следовательно, входной светофор останется гореть двумя желтыми. Там есть и контакты других реле(смотрите альбомы), но определяющим является именно сигнальное реле.

при сквозном пропуске, входной всегда горит зеленый. при безостановочном два желтых, верхний мигающий, а это значит вы едите на боковой путь, вам так же открыт выходной на разрешающее показание. вопросы еще будут?точно шчис. Скорости согласно ТРА станции