При данной схемной реализации основного маршрута от входного до НМ6А нет, т.к. от нажатия кнопок начала и конца маршрута (НЧ-Ч6А) всегда будут устанавливаться два элементарных поездных маршрута: маршрут приема по входному НЧ на 6БП и маршрут передачи от НМ6Б на 6АП.
Установить маршрут приема на 6АП удастся только вариантный, задаваемый нажатием промежуточной вариантной кнопки (там куча маневровых светофоров, как настроено, вам виднее). Если требуется сохранить такой порядок, в перечнях маршрутов указывайте как есть.
Если при перепроектировании демонтировать 6БПАКН...., то можно будет настроить основные маршруты по входным на 6АП. Если станция действующая, то сложившийся годами порядок движения лучше не менять