Мы в такой же ситуации нормально все от жд получили.
Модернизация, как я пониманию, будет за счет заказчика, не за счет РЖД? Если так, то не беспокойтесь. Как только заказчик прибудет с деньгами в управление дороги, то все исходники вам тут же выдадут